El fútbol americano universitario (inglés: college football) es una categoría del fútbol futbol camisetas americano. El Athletic había desembolsado una gran suma de dinero por reforzar la plantilla de cara a la nueva temporada 1997/98. Se gastó 2.000 millones de las antiguas pesetas (12 millones de €) en el fichaje del defensa Roberto Ríos, siendo el fichaje español más elevado de la época. Gracias a esa final, el Athletic se clasificó para disputar la nueva Europa League (versión renovada de la Copa de la UEFA) y para jugar la Supercopa de España contra el propio F. C. Barcelona, que de nuevo resultó vencedor. Gracias a esto el Athletic logra clasificarse para la UEFA. Estos jugadores sumado a otros que ya estaban como Josu Urrutia, Aitor Larrazabal, Bittor Alkiza, Rafael Alkorta, José Ángel Ziganda o el propio Julen Guerrero, hicieron posible el regreso a la Liga Europa de la UEFA. Esta temporada también supuso el principio del fin para Julen Guerrero; San Mamés veía como su preciada perla, el gran ídolo de los 90, cada vez era más habitual en los banquillos. En el Mundial 2014, realizado en Brasil, Inglaterra fue eliminado en primera ronda por primera vez desde el Mundial 1958. Incluida en el Grupo D con Costa Rica, Uruguay e Italia, era favorita a clasificarse a octavos de final junto a Italia.

Cuando ya la afición rayada pedía a gritos un cambio de mando, Protexa decidió vender el equipo, el cual sería adquirido en 1989 por un grupo de empresarios regiomontanos, teniendo como figuras principales a los hermanos Jaime y Manuel Rivero Santos, quienes serían presidente y vicepresidente, respectivamente. Durante el verano de 2004, se convocaron elecciones anticipadas, en las que Fernando Lamikiz fue elegido como nuevo presidente del club. Por primera vez, Brasil se queda fuera antes de las semifinales, la única vez que no llegó a la final fue en 2004, cayendo también en los penaltis frente a España. Pero el acto principal fue el partido entre el Athletic y la selección de Brasil. Ganaron al menos dos títulos anuales de la Primera División de Chile, alguno de ligas nacionales extranjeras o destacaron con una selección chilena. Tres días más tarde se enfrentaron a Checoslovaquia, llegando al descanso con empate a uno, aunque finalmente perdieron por 3-1. En su último partido, la selección griega consiguió un empate 0-0 ante el que finalmente sería campeón de la Eurocopa de 1980 la selección de Alemania Occidental. La falta de entendimiento entre Clemente y sus jugadores, rompieron un equipo hasta entonces campeón.

Estos torneos se disputaron durante dos años, hasta verse interrumpido por el estallido de la Guerra Civil Española. El azar quiso que este último partido de Liga se jugase en San Mamés, Joseba Etxeberria inauguró el marcador en el minuto 40′ de la primera parte y el equipo rojiblanco aguantó el resultado hasta el final del partido. Los octavos de final a diferencia de las rondas anteriores, se disputan a doble partido, pasando a la siguiente fase el equipo con mayor resultado global. La Provincia – Diario de Las Palmas. Txetxu Rojo sería el encargado de dirigir al equipo en la nueva temporada 2000/01, con una plantilla de transición que mezclaba la juventud de las jóvenes promesas como Asier del Horno, Fran Yeste, Pablo Orbaiz o Dani Aranzubia con la veteranía de los Josu Urrutia, Bittor Alkiza, Aitor Larrazabal o Rafael Alkorta. Durante ese tiempo Heynckes renovó el equipo dando más protagonismo a los canteranos, entre los que se encontraban Aranzubía, Del Horno, Luis Prieto, Murillo, Aitor Ocio, Gurpegui y Yeste. A mitad de temporada Irureta es cesado y ocupa su lugar José María Amorrortu, que termina la campaña. A mitad de esta campaña, Kendall es cesado y recala en el banquillo el exjugador rojiblanco Txetxu Rojo.

Para el siguiente curso le releva en el banquillo el serbio Dragoslav Stepanovic. La primera decisión del nuevo presidente es cesar a Jupp Heynckes y poner a cargo del banquillo a Javier Irureta. Al comienzo de la temporada 2001-02 Javier Uría fue elegido nuevo presidente y trajo de vuelta a Jupp Heynckes, que inició su segundo ciclo en el banquillo rojiblanco. Para dicha temporada, incorporan a Iribar como entrenador, pero su paso por el banquillo rojiblanco no termina de ser el esperado. De nuevo se sacó la gabarra y de nuevo se realizó una celebración como la del año anterior, esta vez para celebrar un histórico doblete, que además proporcionaba de forma automática la consecución de la Supercopa, lo que por este motivo se podría catalogar como un triplete. Sea como fuere, el Athletic lo pasó difícil para salvar la categoría, en una temporada en la que solo separaban 4 puntos entre el 12.º (el Athletic) y el 20.º (el C. D. Numancia). El Estadio Doroteo Guamuch Flores, también conocido como “El Coloso de la Zona 5”, es su estadio oficial y cuenta con una capacidad de 26 000 espectadores.